MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS3

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019433	CTA	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019433	T	7	7	3086	3092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019433	AT	3	6	3114	3119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019433	TAT	2	6	3128	3133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019433	CAAG	2	8	3141	3148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019433	A	6	6	3163	3168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019433	ACCT	2	8	3173	3180	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019433	TTTA	2	8	3188	3195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019433	TAA	2	6	3246	3251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019433	CTT	2	6	3376	3381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019433	TAA	2	6	3405	3410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019433	GTGA	2	8	4345	4352	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019433	TGC	2	6	4355	4360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019433	TGGG	2	8	4361	4368	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019433	T	6	6	4373	4378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019433	CGA	2	6	4441	4446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019433	CA	3	6	4503	4508	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019433	TTA	2	6	4577	4582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019433	AATG	2	8	4671	4678	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019433	TAG	2	6	4688	4693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019433	ACT	2	6	4707	4712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019433	T	7	7	4712	4718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019433	TGAA	2	8	4769	4776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019433	A	6	6	4814	4819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019433	TC	3	6	4820	4825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019433	TGTT	2	8	4832	4839	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019433	A	6	6	4855	4860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019433	GAA	3	9	4875	4883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019433	T	7	7	4893	4899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019433	CTT	2	6	4900	4905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019433	AAAG	2	8	4918	4925	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019433	TATTT	2	10	4936	4945	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019433	TGT	2	6	5116	5121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019433	TTA	2	6	5151	5156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019433	ACTC	2	8	5260	5267	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019433	CTA	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019433	TGT	2	6	5297	5302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019433	T	6	6	5385	5390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019433	TCA	2	6	5431	5436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019433	TGAAT	2	10	5556	5565	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019433	TTG	2	6	5569	5574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019433	A	7	7	5583	5589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019433	GTT	2	6	5624	5629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019433	TCTTT	2	10	5756	5765	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_019433	T	7	7	5825	5831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019433	GAT	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019433	A	7	7	5863	5869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019433	A	6	6	5871	5876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019433	TA	5	10	5888	5897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019433	TA	3	6	5905	5910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019433	A	9	9	5936	5944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019433	TA	3	6	5971	5976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019433	CAA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019433	A	6	6	5982	5987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019433	TA	3	6	5993	5998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019433	CAA	2	6	6000	6005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019433	A	6	6	6004	6009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019433	CAA	2	6	6022	6027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019433	A	6	6	6026	6031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019433	CTT	2	6	6047	6052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019433	TGTT	2	8	6053	6060	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019433	TA	3	6	6068	6073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019433	ATA	2	6	6079	6084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019433	GAA	2	6	6092	6097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019433	TC	3	6	6098	6103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019433	TTC	2	6	6116	6121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019433	ACTC	2	8	6134	6141	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.